Flessingue dispose de deux ports de plaisance.
En premier lieu le Schelde Jachthaven, situé dans le Binnenhaven à environ 2 kilomètres du centre-ville. Vous pouvez y entrer chaque jour après avoir contacté au préalable la capitainerie au +31 (0)118 465912 / 412348 ou 413868.
Au cœur de la vieille ville se trouve ensuite l'ancien port de pêche, aujourd'hui aménagé en porte de plaisance. Le port de Michiel de Ruyter est joignable par téléphone au +31(0)118 - 419244, fax +31 (0)118 - 4146505 et par courriel à l'adresseinfo@montparnasse.nl.